第１条第２項中
「もののほか、」の下に「医薬品技術等に関する基礎的研究に関する業務を行い、及び」を加える。
第４条の２第３項に後段として次のように加える。
この場合において、政府は、第27条第２項第１号及び第２号に掲げる業務並びにこれらに附帯する業務、同条第３項第１号に掲げる業務並びに同条第４項第１号に掲げる業務（以下「基礎的研究業務」という。）に必要な資金又は同条第２項第３号から第８号までに掲げる業務及びこれらに附帯する業務、同条第３項第２号に掲げる業務並びに同条第４項第２号に掲げる業務（以下「研究振興業務」という。）に必要な資金のそれぞれに充てるべき金額を示すものとする。
第４条の２第４項を次のように改める。
４ 前項の規定により基礎的研究業務に必要な資金に充てるべきものとして出資された政府の出資金及びこれを運用した場合に生ずる利子その他の運用利益金は基礎的研究業務の財源に、同項の規定により研究振興業務に必要な資金に充てるべきものとして出資された政府の出資金及び政府以外の者の出資金並びにこれらを運用した場合に生ずる利子その他の運用利益金は研究振興業務の財源に、それぞれ充てなければならない。
第10条第３号中
「に関する試験研究の促進」を「の開発の振興」に改める。
第27条第２項第12号を同項第14号とし、
同項第11号中
「第５号」を「第７号」に改め、
同号を同項第13号とし、
同項第10号中
「第８号」を「第10号」に改め、
同号を同項第12号とし、
同項第１号から第９号までを２号ずつ繰り下げ、
同項に第１号及び第２号として次の２号を加える。
1．医薬品技術に関する基礎的研究を行うこと。
2．前号に掲げる業務に係る成果を普及すること。
第27条第３項第１号中
「から第６号まで」を「及び第２号」に、
「業務及び」を「業務並びに」に改め、
同項第３号中
「前項第９号から第11号まで」を「前項第11号から第13号まで」に改め、
同号を同項第４号とし、
同項第２号中
「前項第７号及び第８号」を「前項第９号及び第10号」に改め、
同号を同項第３号とし、
同項第１号の次に次の１号を加える。
2．前号に規定する技術につき、前項第３号から第８号までに掲げる業務及びこれらに附帯する業務に相当する業務
第27条第４項中
第３号を第４号とし、
第２号を第３号とし、
第１号を第２号とし、
同号の前に次の１号を加える。
1．医薬品技術等に関する基礎的研究に関する第１条第２項の目的を達成するために必要な業務（次号及び第３号に掲げる業務を除く。）
第34条に次の１項を加える。
３ 機構は、厚生大臣の認可を受けて定める基準に従つて、第27条第２項第１号に掲げる業務及び同条第３項第１号に掲げる業務（同条第２項第１号に掲げる業務に相当する業務に限る。）の一部を委託することができる。
第35条の２中
「第27条第２項第７号の」を「第27条第２項第９号の」に、
「同条第３項第２号」を「同条第３項第３号」に、
「第27条第２項第７号及び第８号」を「第27条第２項第９号及び第10号」に、
「同条第４項第２号」を「同条第４項第３号」に改める。
第38条に次の１項を加える。
３ 機構は、第１項の規定による厚生大臣の承認を受けた財務諸表並びに前項の事業報告書及び決算報告書をその事務所に備えて置かなければならない。
第38条の３第３号を次のように改める。
3．基礎的研究業務及び希少疾病用医薬品等開発振興業務
第38条の３第４号中
「第27条第２項第９号から第11号まで」を「第27条第２項第11号から第13号まで」に、
「同条第３項第３号」を「同条第３項第４号」に、
「同条第４項第３号」を「同条第４項第４号」に改める。
第47条の２第１項中
「機構は、」の下に「研究振興業務に係る出資について」を加える。
第47条の３第１項中
「第27条第２項第９号」を「第27条第２項第11号」に、
「同条第３項第３号」を「同条第３項第４号」に、
「同条第２項第９号」を「同条第２項第11号」に改める。
第51条第１項第１号及び第２号並びに同条第２項中
「研究振興業務」を「基礎的研究業務、研究振興業務」に改める。
